Vereinigte Staaten
Retym
MyOme
Machine Learning Engineer
Vereinigte Staaten
Menlo Park, California, United States
PythonSQLAWSGCPDockerKubernetes
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Überblick über die Position
Die Mission von MyOme ist es, Patienten ein Leben lang klinisch verwertbare genetische Informationen zur Verfügung zu stellen. Wir kombinieren klinische Ganzgenomsequenzierung, fortschrittliche KI-Methoden zur Genominterpretation sowie nahtlose digitale Tools, mit denen Ärzte und Patienten Ergebnisse anfordern und abrufen können. Unser Team besteht aus erfahrenen Unternehmern, Wissenschaftlern und Führungskräften und wird von erstklassigen Investoren unterstützt.
MyOme ist ein CLIA-zertifiziertes Unternehmen für klinische Ganzgenomsequenzierung, das KI-Risikomodelle entwickelt, die klinische Daten mit Genomik kombinieren, um Krankheitsrisiken Jahre vor ihrem Ausbruch vorherzusagen. Wir suchen einen Machine Learning Engineer mit fundierter Expertise in machine learning und der Entwicklung fortschrittlicher deep learning-Modelle. Sie entwickeln und verbessern deep learning-Risikomodelle und verantworten den gesamten Prozess vom trainierten Modell bis hin zu einem zuverlässigen, überwachten und klinisch berichtsfähigen Dienst, wobei Sie moderne KI-Methoden (LLM und agentenbasierte Ansätze) dort einsetzen, wo sie einen Mehrwert bieten. Sie arbeiten direkt mit Modellentwicklern sowie mit klinischen, regulatorischen, Produkt- und Engineering-Teams zusammen.
Ihre Aufgaben
- Entwicklung und Verbesserung von deep learning-Risikomodellen: Architekturdesign, multimodale EHR- und Genomik-Fusion, zeitliche und sequenzielle Modellierung von Patientenhistorien, Deep-Survival-Modelle, Repräsentationslernen sowie rigorose Ablationsstudien und Benchmarking.
- Überführung von Krankheitsrisikomodellen in die Produktion als versionierte Pakete (Modellgewichte, Koeffizienten für Survival-Modelle, Kalibrierung, PRS-Skalierung) mit reproduzierbarem Training und einer Modell-Registry.
- Aufbau und Wartung von Inferenzdiensten (Python, FastAPI, Docker) und deren Integration in die Berichts- und Datenplattformen von MyOme.
- Implementierung von Kalibrierung, Rekalibrierung für neue Populationen und Ergebnisberichten (absolutes Risiko über definierte Zeiträume, Perzentile, Risikostufen).
- Einrichtung von Deployment-Monitoring für Kalibrierung, Diskriminierung, Input-Drift und Abdeckung mit definierten Triggern für das Retraining.
- Durchführung und Automatisierung externer Validierungen auf Partnerdatensätzen in sicheren Umgebungen.
- Koordination der Modellevaluierung an klinischen Studienzentren gemeinsam mit dem Hiring Manager, einschließlich Datenaufnahme der Standorte, Harmonisierung, Durchführung der Evaluierung und Berichterstattung der Ergebnisse.
- Anwendung von LLMs und agentenbasierten Methoden, wo sie einen messbaren Mehrwert bieten, wie z. B. strukturierte Extraktion aus klinischen Notizen, automatisierte Evaluierung und abgesicherte Erläuterung von Ergebnissen.
- Erstellung von Validierungsberichten, Modellkarten und Dokumentationen zur Änderungskontrolle zur Unterstützung von CLIA- und behördlichen Prüfungen.
Was Sie mitbringen
- Master oder PhD in Informatik, Statistik, biomedizinischer Informatik, Bioingenieurwesen oder einem verwandten Bereich (PhD bevorzugt) oder gleichwertige Erfahrung; 5+ Jahre Erfahrung in der Entwicklung von ML- und deep learning-Modellen, davon mindestens 3 Jahre mit Modellen in der Produktion.
- Fundierte ML-Grundlagen: überwachtes Lernen, Survival-Analyse (Cox- und Deep-Survival-Modelle), Kalibrierung, Klassenungleichgewicht, Leakage und Kohorten-Shift sowie Evaluierung (AUROC, C-Index, Kalibrierungskurven, Entscheidungskurven).
- Fundierter Hintergrund in der Entwicklung fortschrittlicher deep learning-Modelle: Entwurf, Training und Debugging moderner Architekturen in PyTorch (Transformer, Sequenz- und Zeitmodelle, multimodale Fusion, Deep-Survival-Modelle) mit nachweisbaren Erfolgen bei Modellen, die starke Baselines übertreffen.
- Rigorose experimentelle Praxis: Ablationen, Hyperparameter-Suche, Regularisierung und Überanpassungskontrolle, Reproduzierbarkeit und ehrlicher Vergleich mit Baselines.
- Produktions-ML-Engineering: Packaging, APIs, Container, CI/CD, Testing, Modellversionierung und Monitoring.
- Erfahrung im Aufbau und der Evaluierung von LLM-basierten Systemen (Prompting, Tool-Use und Agenten, Retrieval, strukturierte Extraktion) mit quantitativer Evaluierung.
- Starke Kenntnisse in Python und SQL; vertraut mit großen tabellarischen Datensätzen und Cloud-Umgebungen (GCP oder AWS).
- Klare Kommunikationsfähigkeit, um das Modellverhalten gegenüber Klinikern und Produktpartnern zu erklären.
Bevorzugte / Bonus-Qualifikationen
- Erfahrung mit EHR-Daten (OMOP, ICD, LOINC, RxNorm, zeitliche Merkmale), idealerweise All of Us, UK Biobank oder Daten aus Gesundheitssystemen.
- Vertrautheit mit polygenen Risikoscores oder statistischer Genetik.
- Erfahrung in regulierten Umgebungen (CLIA, CAP, HIPAA, FDA SaMD, Design Controls).
- MLOps-Tools (MLflow oder ähnlich, Airflow oder Prefect, Kubernetes).
- Publikationen oder veröffentlichte Produkte im Bereich klinisches ML.
Standort, Vergütung und Leistungen
Standort: Hybrid, 2 bis 3 Tage vor Ort auf unserem Laborgelände in Menlo Park, CA.
Vergütung: Jährliche Gehaltsspanne von $170,000 - $200,000, abhängig von der Erfahrung. Diese Stelle ist für Aktienoptionen berechtigt.
Gehaltsspanne für die San Francisco Bay Area $170,000—$200,000 USD
Vielfalt, Inklusion und Chancengleichheit
MyOme schätzt Vielfalt in jeder Form. Wir glauben, dass unterschiedliche Perspektiven zu besserer Wissenschaft und besseren Patientenergebnissen führen. Wir sind ein Arbeitgeber, der Chancengleichheit fördert und sich verpflichtet, einen inklusiven Arbeitsplatz zu schaffen, der jeden Einzelnen stärkt.
Warum bei MyOme arbeiten?
Kommen Sie zu uns, wenn Sie:
- An der Schnittstelle von Gesundheitswesen und Technologie etwas bewegen und die Art und Weise verändern wollen, wie Menschen auf genetischer Ebene mit ihrer Gesundheit umgehen
- Gerne anpacken, Eigeninitiative zeigen und die Befugnis haben, eine Führungsrolle zu übernehmen
- Bescheidenheit, Transparenz und kollaborative Problemlösung schätzen
- In schnelllebigen, dynamischen Umgebungen mit klugen, motivierten Teamkollegen aufblühen
- Wettbewerbsfähige Vergütung, sinnvolle Unternehmensanteile und exzellente Leistungen schätzen
Mehr erfahren: myome.com
Leistungen
- Umfassende Krankenversicherung (Kranken-, Zahn- und Augenversicherung)
- 401k
- Unbegrenzter bezahlter Urlaub (PTO)
- Möglichkeiten zur beruflichen Weiterentwicklung
- Vom Unternehmen gesponserte Off-sites und Team-Mahlzeiten bei persönlichen Treffen
- Direkter Zugang zur Unternehmensführung und Möglichkeiten für berufliches Wachstum
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