États-Unis
Retym
MyOme
Ingénieur Machine Learning
États-Unis
Menlo Park, California, United States
PythonSQLAWSGCPDockerKubernetes
Traduction automatique. Consultez l’original.
Présentation du poste
La mission de MyOme est de fournir aux patients des informations génétiques cliniquement exploitables tout au long de leur vie. Nous combinons le séquençage du génome entier de qualité clinique, des méthodes d'IA avancées pour l'interprétation du génome et des outils numériques fluides permettant aux médecins et aux patients de commander et d'accéder aux résultats. Notre équipe est composée d'entrepreneurs, de scientifiques et d'opérateurs chevronnés, et nous sommes soutenus par des investisseurs de premier plan.
MyOme est une entreprise de séquençage du génome entier clinique certifiée CLIA qui développe des modèles de risque basés sur l'IA, combinant des données cliniques et génomiques pour prédire le risque de maladie des années avant son apparition. Nous recrutons un ingénieur Machine Learning possédant une expertise approfondie en machine learning et dans le développement de modèles de deep learning avancés. Vous développerez et améliorerez des modèles de risque de deep learning et serez responsable du cycle de vie, du modèle entraîné jusqu'au service fiable, surveillé et cliniquement exploitable, en appliquant des méthodes d'IA modernes (LLM et agents) là où elles apportent une valeur ajoutée. Vous travaillerez directement avec les développeurs de modèles ainsi qu'avec les équipes cliniques, réglementaires, produit et ingénierie.
Vos missions
- Développer et améliorer les modèles de risque de deep learning : conception d'architecture, fusion multimodale DSE + génomique, modélisation temporelle et séquentielle des antécédents des patients, modèles de survie profonds, apprentissage de représentations, ainsi qu'ablation et benchmarking rigoureux.
- Mettre en production les modèles de risque de maladie sous forme de bundles versionnés (poids du modèle, coefficients du modèle de survie, calibration, mise à l'échelle PRS), avec un entraînement reproductible et un registre de modèles.
- Construire et maintenir des services d'inférence (Python, FastAPI, Docker) et les intégrer aux plateformes de reporting et de données de MyOme.
- Implémenter la calibration, la recalibration pour de nouvelles populations et le reporting des scores (risque absolu sur des horizons définis, percentiles, niveaux de risque).
- Mettre en place une surveillance du déploiement pour la calibration, la discrimination, la dérive des entrées et la couverture, avec des déclencheurs de réentraînement définis.
- Exécuter et automatiser la validation externe sur des jeux de données partenaires dans des environnements sécurisés.
- Coordonner l'évaluation des modèles sur les sites d'essais cliniques avec le responsable du recrutement, incluant l'acquisition des données du site, l'harmonisation, les exécutions d'évaluation et le reporting des résultats.
- Appliquer les méthodes LLMs et agents là où elles apportent une valeur mesurable, comme l'extraction structurée à partir de notes cliniques, l'évaluation automatisée et l'explication encadrée des résultats.
- Produire des rapports de validation, des fiches de modèles et une documentation de contrôle des changements pour soutenir les examens CLIA et réglementaires.
Profil recherché
- Master ou doctorat en informatique, statistiques, informatique biomédicale, bio-ingénierie ou domaine connexe (doctorat préféré), ou expérience équivalente ; 5+ années de développement de modèles ML et de deep learning, dont au moins 3 années avec des modèles en production.
- Solides fondamentaux en ML : apprentissage supervisé, analyse de survie (modèles de Cox et de survie profonds), calibration, déséquilibre des classes, fuite de données et dérive de cohorte, et évaluation (AUROC, C-index, courbes de calibration, courbes de décision).
- Solide expérience en développement de modèles de deep learning avancés : conception, entraînement et débogage d'architectures modernes en PyTorch (transformers, modèles séquentiels et temporels, fusion multimodale, modèles de survie profonds), avec un historique de modèles surpassant les références établies.
- Pratique expérimentale rigoureuse : ablations, recherche d'hyperparamètres, régularisation et contrôle du surapprentissage, reproductibilité et comparaison honnête avec les références.
- Ingénierie ML en production : packaging, APIs, conteneurs, CI/CD, tests, versioning de modèles et monitoring.
- Expérience dans la construction et l'évaluation de systèmes basés sur LLM (prompting, utilisation d'outils et agents, récupération, extraction structurée) avec évaluation quantitative.
- Maîtrise de Python et SQL ; à l'aise avec les grands jeux de données tabulaires et les environnements cloud (GCP ou AWS).
- Communicant clair capable d'expliquer le comportement des modèles aux cliniciens et aux partenaires produit.
Qualifications souhaitées / Bonus
- Expérience avec les données DSE (OMOP, ICD, LOINC, RxNorm, caractéristiques temporelles), idéalement All of Us, UK Biobank ou données de systèmes de santé.
- Familiarité avec les scores de risque polygénique ou la génétique statistique.
- Expérience dans des environnements réglementés (CLIA, CAP, HIPAA, FDA SaMD, contrôles de conception).
- Outils MLOps (MLflow ou similaire, Airflow ou Prefect, Kubernetes).
- Publications ou produits mis en production dans le domaine du ML clinique.
Localisation, rémunération et avantages
Localisation : Hybride, 2 à 3 jours sur site sur notre campus de laboratoire à Menlo Park, CA.
Rémunération : Fourchette de salaire annuel de $170,000 - $200,000, selon l'expérience. Ce poste est éligible à l'actionnariat.
Fourchette de salaire dans la région de la baie de San Francisco $170,000—$200,000 USD
Diversité, inclusion et égalité des chances
MyOme valorise la diversité sous toutes ses formes. Nous pensons que des perspectives diverses favorisent une meilleure science et de meilleurs résultats pour les patients. Nous sommes un employeur garantissant l'égalité des chances, engagé à créer un lieu de travail inclusif qui valorise chaque individu.
Pourquoi rejoindre MyOme ?
Rejoignez-nous si vous :
- Souhaitez avoir un impact à l'intersection de la santé et de la technologie, en changeant la façon dont les gens interagissent avec leur santé au niveau génétique
- Aimez vous impliquer, prendre des initiatives et être habilité à diriger
- Valorisez l'humilité, la transparence et la résolution collaborative de problèmes
- Prospérez dans des environnements dynamiques et rapides avec des collègues intelligents et motivés
- Appréciez une rémunération compétitive, un actionnariat significatif et d'excellents avantages
En savoir plus : myome.com
Avantages
- Couverture santé complète (santé, dentaire et vision)
- 401K
- Congés payés illimités
- Opportunités de développement professionnel
- Off-sites sponsorisés par l'entreprise et repas d'équipe lors des réunions en présentiel
- Accès direct à la direction de l'entreprise et opportunités d'évolution de carrière
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