Retym
MyOme
Ingeniero de Machine Learning
Descripción del puesto
La misión de MyOme es proporcionar información genética clínicamente accionable a los pacientes a lo largo de toda su vida. Combinamos la secuenciación del genoma completo de grado clínico, métodos avanzados de IA para la interpretación del genoma y herramientas digitales integradas para que los médicos y pacientes puedan solicitar y acceder a los resultados. Nuestro equipo está compuesto por emprendedores, científicos y operadores experimentados, y contamos con el respaldo de inversores de primer nivel.
MyOme es una empresa de secuenciación del genoma completo clínico con certificación CLIA que desarrolla modelos de riesgo de IA que combinan datos clínicos con genómica para predecir el riesgo de enfermedades años antes de su aparición. Estamos buscando un ingeniero de Machine Learning con amplia experiencia en machine learning y desarrollo avanzado de modelos de deep learning. Desarrollarás y mejorarás modelos de riesgo de deep learning y serás responsable de todo el proceso, desde el modelo entrenado hasta un servicio fiable, monitorizado y clínicamente reportable, aplicando métodos modernos de IA (LLM y agentes) donde aporten valor. Trabajarás directamente con los desarrolladores de modelos y con los equipos de clínica, regulación, producto e ingeniería.
Lo que harás
- Desarrollar y mejorar modelos de riesgo de deep learning: diseño de arquitectura, fusión multimodal de HCE + genómica, modelado temporal y de secuencias de historiales de pacientes, modelos de supervivencia profunda, aprendizaje de representación, y ablación y evaluación comparativa rigurosas.
- Poner en producción modelos de riesgo de enfermedades como paquetes versionados (pesos del modelo, coeficientes de modelos de supervivencia, calibración, escalado de PRS), con entrenamiento reproducible y un registro de modelos.
- Construir y mantener servicios de inferencia (Python, FastAPI, Docker) e integrarlos con las plataformas de datos y de informes de MyOme.
- Implementar la calibración, recalibración para nuevas poblaciones e informes de puntuación (riesgo absoluto en horizontes definidos, percentiles, niveles de riesgo).
- Establecer la monitorización del despliegue para calibración, discriminación, deriva de entrada y cobertura, con disparadores de reentrenamiento definidos.
- Ejecutar y automatizar la validación externa en conjuntos de datos de socios en entornos seguros.
- Coordinar la evaluación de modelos en centros de ensayos clínicos con el responsable de contratación, incluyendo la ingesta de datos del centro, armonización, ejecuciones de evaluación e informes de resultados.
- Aplicar LLMs y métodos de agentes donde aporten un valor medible, como la extracción estructurada de notas clínicas, evaluación automatizada y explicación de resultados con salvaguardas.
- Elaborar informes de validación, fichas de modelo y documentación de control de cambios para respaldar la revisión regulatoria y de CLIA.
Lo que necesitarás
- Máster o doctorado en informática, estadística, informática biomédica, bioingeniería o un campo relacionado (se prefiere doctorado), o experiencia equivalente; 5+ años desarrollando modelos de ML y deep learning, incluyendo al menos 3 años con modelos en producción.
- Sólidos fundamentos de ML: aprendizaje supervisado, análisis de supervivencia (modelos Cox y de supervivencia profunda), calibración, desequilibrio de clases, fuga y cambio de cohorte, y evaluación (AUROC, C-index, curvas de calibración, curvas de decisión).
- Sólida experiencia en desarrollo avanzado de modelos de deep learning: diseño, entrenamiento y depuración de arquitecturas modernas en PyTorch (transformers, modelos de secuencia y temporales, fusión multimodal, modelos de supervivencia profunda), con un historial de modelos que superan a las líneas base sólidas.
- Práctica experimental rigurosa: ablaciones, búsqueda de hiperparámetros, regularización y control de sobreajuste, reproducibilidad y comparación honesta frente a líneas base.
- Ingeniería de ML en producción: empaquetado, APIs, contenedores, CI/CD, pruebas, versionado de modelos y monitorización.
- Experiencia en la construcción y evaluación de sistemas basados en LLM (prompting, uso de herramientas y agentes, recuperación, extracción estructurada) con evaluación cuantitativa.
- Sólidos conocimientos de Python y SQL; comodidad con grandes conjuntos de datos tabulares y entornos en la nube (GCP o AWS).
- Comunicador claro capaz de explicar el comportamiento del modelo a médicos y socios de producto.
Cualificaciones preferentes / Ventajas
- Experiencia con datos de HCE (OMOP, ICD, LOINC, RxNorm, características temporales), idealmente All of Us, UK Biobank o datos de sistemas de salud.
- Familiaridad con puntuaciones de riesgo poligénico o genética estadística.
- Experiencia en entornos regulados (CLIA, CAP, HIPAA, FDA SaMD, controles de diseño).
- Herramientas de MLOps (MLflow o similar, Airflow o Prefect, Kubernetes).
- Publicaciones o productos lanzados en ML clínico.
Ubicación, compensación y beneficios
Ubicación: Híbrido, de 2 a 3 días presenciales en nuestro campus de laboratorio en Menlo Park, CA.
Compensación: Rango salarial anual de $170,000 - $200,000, acorde a la experiencia. Este puesto es elegible para capital social (equity).
Rango salarial del área de la Bahía de San Francisco $170,000—$200,000 USD
Diversidad, inclusión e igualdad de oportunidades
MyOme valora la diversidad en todas sus formas. Creemos que las diversas perspectivas impulsan una mejor ciencia y mejores resultados para los pacientes. Somos un empleador que ofrece igualdad de oportunidades y estamos comprometidos a crear un lugar de trabajo inclusivo que empodere a cada individuo.
¿Por qué trabajar en MyOme?
Únete a nosotros si:
- Quieres tener un impacto en la intersección de la salud y la tecnología, cambiando la forma en que las personas se relacionan con su salud a nivel genético
- Disfrutas arremangarte, tomar la iniciativa y tener la capacidad de liderar
- Valoras la humildad, la transparencia y la resolución colaborativa de problemas
- Prosperas en entornos dinámicos y de ritmo rápido con compañeros inteligentes y motivados
- Aprecias una compensación competitiva, capital social significativo y excelentes beneficios
Más información: myome.com
Beneficios
- Cobertura sanitaria integral (salud, dental y visión)
- 401K
- Vacaciones pagadas ilimitadas
- Oportunidades de desarrollo profesional
- Eventos fuera de la oficina patrocinados por la empresa y comidas de equipo durante las reuniones presenciales
- Acceso directo al liderazgo de la empresa y oportunidad de crecimiento profesional
